בשעה 02:30 בבוקר של ה-25.9.1999 העבריין הבכיר, פנחס בוחבוט בן ה-39 מאשקלון, ישן על אחת המיטות במכון לאף אוזן גרון בבית החלים "שיבא" תל השומר. רק עשרה ימים לפני כן הוא ניצל מניסיון חיסול כאשר יצא מביתו עם בנו התינוק, נכנס למכוניתו, עבריינים חסמו את דרכו וירו בו כמה כדורים ונמלטו. בנו נפצע קל, בוחבוט נפצע קשה מקליע שחדר לצווארו. אימו של בוחבוט הלכה לישון במכונית שחנתה ליד המכון ובוחבוט נותר לבדו. ישן שנת ישרים ללא שמירה או השגחה של המשטרה. באותן דקות עלו במדרגות המכון שני עבריינים שהתחזו לקציני משטרה בדרגת מפקח, הם נכנסו למחלקה שאלו את אחת האחיות: "איפה נמצא בוחבוט"?
"קציני המשטרה" הבחינו בחבר של בוחבוט, ואמרו לו שהגיעו לחקור אותו. הוא הביע תמיהה למה בשעה כל כך מאוחרת ובעט באחד המתחזים. באותם רגעים בוחבוט התעורר יצא לכיוון המסדרון, ושאל: "מה קרה באתם לחקור אותי בשעה כזו?". אחד ה"קצינים" שלף אקדח עם משתיק קול וירה ירייה אחת בראשו של בוחבוט. לא מכן איים על האנשים שהיו במקום שיירה גם בהם אם ינסו להפריע לו ולחברו לברוח מהמקום. השניים ברחו מהמקום.
תוך דקות הבינו גם במשטרה שלא מדובר בקצינים אלא במחסלים שבאו לסיים את העבודה ולחסל את בוחבוט לאחר שניצל מניסיון החיסול הקודם.
שוטרים רבים זרמו למחלקה. מהר מאוד הבינו את גודל המחדל, העובדה שהעבריין בוחבוט נותר ללא אבטחה משטרתית ונתון לגורלם של יריביו העבריינים.
מאוחר יותר תתברר התמונה בשלמותה. הרוצח של בוחבוט שמעולם לא הועמד לדין, השוטר לשעבר צחי בן אור שחצה את הקווים והפך להיות רוצח שכיר בשירות עבריינים בכירים מאזור לכיש, נמלט למקסיקו. החשד הוא שהאחים עודד ושרון פריניאן דאגו לשלוח את בן אור לבצע את הרצח של יריבם בוחבוט. יחד עימו היה שותף לרצח על פי החשד שמעון אלמקייס.
"פנחס בוחבוט היה המלך של אשקלון, אף אחד לא התעסק איתו. הוא היה עבריין מפחיד ואלים אבל גם ידע לתרום בסתר לנזקקים ועזר לאנשים, היו לו הרבה סכסוכים עם עבריינים מהעיר ובלכיש שרצו לחסל אותו. מרוב שהם פחדו ממנו ומהכוח שלו הם שכרו רוצחים שכירים כמו צחי בן אור, שקיבל ארגזים של כסף כדי לחסל את בוחבוט בבית חולים", סיפר עבריין אשקלוני שהכיר את בוחבוט, "הם רצו את פנחס בקבר בכל מחיר. הם ידעו שכל יום שהוא חופשי החיים שלהם גם בסכנה גדולה".
שנתיים לאחר הרצח, בן אור (בעבר שירת כלוחם יס"מ באזור ירושלים) נעצר בחשד לביצוע שוד. הוא הציע לחוקרים לשמש עד מדינה נגד אלמקייס. הפרקליטות הטילה על כך וטו מוחלט. בן אור נמלט למקסיקו ובשנת 2004 חוסל על ידי עבריינים ישראלים.
"כך המשטרה והפרקליטות החמיצו הזדמנות נדירה לפענח את תיק הרצח של בוחבוט. המדיניות הייתה באותם ימים שלא חותמים הסכמי עדי מדינה עם רוצחים ושותפים לרצח", ציין קצין משטרה לשעבר, "לדעתי זו הייתה טעות, שכן התיק מעולם לא פוענח באופן רשמי. בן אור נרצח במקסיקו ולא הועמד לדין. האחים פריניאן לא הורשעו ברצח וכך גם שמעון אלמקייס".
האחים פריניאן נדונו לחמש שנות מאסר בפועל, סעיף הרצח של בוחבוט נמחק מכתב האישום. אלמקייס הורשע במעורבות לסיוע ברצח ונדון לעשר שנות מאסר בפועל לאחר שבפרקליטות הגיעו למסקנה שהוא לא לחץ על ההדק וכי הרוצח של בוחבוט שמעולם לא הועמד לדין, בן אור הוא הרוצח.
ואז מתפתחת העלילה. מי שהיה מעורב ברצח בן אור היה ראש ארגון פשע כיום ערן חייא וחברו העבריין גדי חזן. השניים, הגיעו למקסיקו. בן אור חוסל על פי החשד מהחשש שיפליל עבריינים, ביניהם האחים פריניאן ברצח בוחבוט. חייא שהיה מעורב ברצח בן אור נדון ל-13 שנה וחזן ל-6 שנים. פרחיה אשתו של בוחבוט תבעה את המדינה על המחדלים החמורים שהתגלו ברצח בעלה.
יוסי בוחבוט ניסה להיכנס לנעליים הגדולות שהשאיר אביו פנחס אבל לא בהצלחה רבה. בוחבוט חבר לראש ארגון הפשע שלום דומרני, גם הוא יליד אשקלון. האחרון פרס עליו את חסותו.
"יוסי לא דומה לאבא שלו פנחס בכלום. הוא לא היה עבריין מהדרג הבכיר יותר, הוא זוטר, 'קבלן ביצוע' של עבריינים בכירים בדרום הארץ. בחור נחמד. קסם של אדם היה. אבל אפס כריזמה", ציין קצין משטרה במחוז הדרומי.
שמו של בוחבוט נקשר אז עם ראש ארגון הפשע ניבי זגורי, כמי שנשלח על פי החשד בהוראת זגורי לזרוק רימון רסס לעבר ביתו של עיתונאי בבאר שבע, ארצי חלפון. כלבתו של חלפון נהרגה, הוא למזלו לא היה בבית וניצל. בוחבוט הורשע ונדון לחמש וחצי שנות מאסר בפועל.
15 שנה לאחר רצח אביו פנחס, בפברואר 2014, יוסי נרצח מתחת לבית אימו באשקלון. על פי החשד מתנקש ארב לו בעת שירד מבית אימו וירה בו מטווח קצר ולא השאיר לו סיכוי לשרוד.
הרוצח נמלט מהמקום. החשד היה שבוחבוט חוסל על רקע רומנטי שניהל עם בת למשפחת פשע מצפון הארץ. הרוצח לא נתפס עד היום ובדומה לתיק אביו גם הרצח שלו נותר לא מפוענח.
החוקרים ניסו להגיע לרוצח השכיר ולמי ששלח אותו אבל נכשלו. החקירה נתקעה עד היום. שמונה שנים אחרי לא התקבל שום מידע חדש שיוביל למעצר המעורבים ברצח בוחבוט ג'וניור. "הרוצח עשה עבודה נקייה. חוץ מקליעים לא מצאנו כלום בזירה. הרוצח לא ביצע שום טעות", אמר גורם במשטרה.
הטרגדיות במשפחת בוחבוט לא נגמרו בזה. בשנה שעברה נרצח שניר בוחבוט, האחיין של פנחס, שחזר בתשובה לפני כמה שנים. באותו אירוע ירי מתחת לביתו של שניר נפצע קשה גם בן דודו אופיר ברנס.