חברות תעופה זרות מבטלות ודוחות טיסות אל ישראל וממנה על רקע האירועים הביטחוניים. בכלליות, הטיסות המסחריות בנתב"ג עדיין פועלות, אך לנוסעים שצפויים להמריא לישראל וממנה הלילה ובימים הקרובים כדאי לבדוק עם חברות התעופה שהטיסות אכן נערכות כסדרן.
מרשות שדות התעופה (רש"ת) נמסר כי "נתב"ג פתוח ופועל בהתאם להנחיות הביטחון והבטיחות. המראות ונחיתות מתקיימות בנמלי התעופה נתב"ג ורמון. מומלץ לנוסעים להתעדכן לגבי זמני טיסות באתר רש"ת ובחברות התעופה השונות".
בחינת לוח ההמראות והנחיתות של נתב"ג מעלה כי בוטלו רבות מהטיסות שתוכננו להגיע לישראל בשעות הערב של שבת משורה ארוכה של יעדים. בהן טיסות של החברות טורקיש איירליינס, וויז אייר, איזיג'ט, ריינאייר, יונייטד איירליינד, אמריקן איירליינד, איבריה איירלנס, לופטהנזה, סוויס איירליינס, חברת LOT הפולנית, אייר בלטיק וחברות נוספות. גם טיסת אל אל ממדריד שתוכננה ל-22:45 בוטלה.
במקביל, חלק מחברות התעופה החלו להודיע לנוסעים שהיו צפויים להמריא לישראל בימים הקרובים כי הטיסות שלהם בוטלו. ל-N12 נודע כי לופטהנזה הודיעה לנוסעי טיסה שתוכננה לצאת לישראל ביום שני מהחוף המזרחי של ארה"ב כי טיסתם בוטלה.
בנוסף בוטלו גם חלק מהטיסות שתוכננו לצאת מנתב"ג הלילה ובשעות הבוקר. עם החברות המבטלות נמנות וויז אייר, טורקיש איירליינס, איזיג'ט, אייר סיישל, ריינאייר, דלתא, KLM וחברות נוספות.
במהלך השבת, מספר חברות תעופה שמפעילות טיסות אל ישראל החזירו את המטוסים חזרה לנמלי התעופה מהן יצאו, או שהסיטו אותם לנחיתה בקפריסין. חברת התעופה לופטהנזה הגרמנית ביטלה טיסה שהיתה אמורה לצאת מנמל התעופה של פרנקפורט. חברת הלואוקוסט ההונגרית וויז אייר ביטלה מספר טיסות לישראל, בהן טיסה שנקבעה לצאת מוורשה בשעות הבוקר.
טיסת איזיג'ט מאמסטרדם שנועדה לצאת הבוקר ב-07:00 בוטלה ונדחתה למחר בבוקר. בנוסף נדחתה בכ-4 שעות ההמראה של טיסת איזיג'ט מניס שתוכננה ל-13:05.
בנוסף חלו עיכובים משמעותיים בשעות הנחיתה של רבות מהטיסות שצפויות היו להגיע לישראל.
בעקבות פניות של מאות ישראלים שנתקעו ביוון ורוצים לחזור לישראל הודיעה חברת ארקיע על הוספת טיסת חילוץ הלילה מאתונה. הטיסה צפויה להמריא מאתונה ב-01:25 (זמן מקומי) בין שבת לראשון. טיסת חילוץ נוספת של החברה צפויה הלילה משארם א-שייח' ב-01:25 (זמן מקומי) בין שבת לראשון). טיסה מלרנקה תצא ביום ראשון.
במקביל הודיעו חברות התעופה הישראליות אל על, ישראייר וארקיע כי נכון לשעות אלו הטיסות ימשיכו לפעול כרגיל. עם זאת החברות הוציאו הנחיות והקלות המיועדות לנוסעים שמבקשים לשנות את מועד טיסותיהם. את התנאים אפשר לברר באתרי החברות.