יותר משבוע אחרי הפיגוע בחווארה שבו נרצחו הלל ויגל יניב, כוחות הביטחון פעלו היום (שלישי) בג'נין ובמהלך המבצע במחנה הפליטים, נהרגו המחבל עבד אל-פתאח ח'רושה שרצח את האחים - איש חמאס משכם, עבד אל-פתח ח'רושה. בעקבות המבצע שבו נהרגו 6 פלסטינים, הערב החלו הפלסטינים לקיים צעדות זעם ברחבי הגדה כאות הזדהות עם ג'נין ובשכם, והם קראו לקיים מחר שביתה כללית.
דוברו של אבו מאזן נביל אבו רודיינה טען: "פעולות ההרג שמבצעים כוחות הביטחון הישראליים נגד עמנו הן מלחמה כוללת והרס כולל. לממשלה הישראלית האחריות להסלמה המסוכנת שעלולה לפוצץ את המצב ולהרוס את כל המאמצים שמטרתם להחזיר את היציבות". אבו רודיינה גם קרא לממשל ארה"ב לנקוט פעולה מיד ולהפעיל לחץ על הממשלה הישראלית "להפסקת פשעיה".
משרד החוץ הפלסטיני האשים: "מעשי הטבח והתוקפנות של ישראל בג'נין ובשכם, מדגישים את הבחירה של ישראל בדרך של הסלמה והיא אחראית על ההשלכות לכך בזירת הסכסוך". גם חבר הלשכה המדינית של הג'יהאד האיסלאמי, אחמד אל-מדלל, איים: "עזה עוקבת מקרוב אחר הנעשה בג'נין ובשכם, היד על ההדק".
דובר חמאס, חאזם קאסם, אמר כי "ישראל תמיד מנסה לפגוע במבצעי הפעולות, אך ניסיונותיה תמיד נכשלים. אנו משבחים את הצעירים שמתעמתים עם ישראל במחנה הפליטים ג'נין ומסרבים להניח את נשקם - זה מוביל לאחדות גדולה של ההתנגדות בשטח".
כאמור, 6 מחבלים חוסלו במהלך הפעילות היום במחנה הפליטים בג'נין. בנוסף, צה"ל פעל גם בשכם ועצר את שני בניו של המחבל עבד אל-פתאח ח'רושה שחוסל בג'נין. לפי דובר צה"ל, שני בניו של המחבל, חאלד ומחמד ח'רושה, חשודים בתכנון וביצוע הפיגוע והם הועברו לחקירת כוחות הביטחון.
במהלך הפעילות במחנה הפליטים בג'נין, "חמושים ירו לעבר הלוחמים מתוך אמבולנס, והשתמשו בו כמחסה", מסרו בדובר צה"ל. "כמו כן, נזרקו לעבר הכוחות מטענים ובלוקים והתפתחו במקום כמה הפרות סדר. הכוחות הגיבו באמצעים לפיזור הפגנות ובירי וזוהו פגיעות. שני רחפנים נפלו במהלך הפעילות, והאירועים מתוחקרים".
במערכת הביטחון הבינו שהמחבל אל-פתאח ח'רושה ברח אל מחנה הפליטים ג'נין במטרה להסתתר, מתוך תפיסה שימצא שם מקלט, כשהוא בטוח שכוחות הביטחון לא יגיעו אליו. צה"ל פעל היום במחנה הפליטים, כ-9 ימים לאחר הפיגוע בחווארה, לאחר שצומצם השטח שבו העריכו שאליו נמלט המחבל.
המחבל אל-פתאח ח'רושה גם קיבל סיוע מקומי, ועל אף האתגר המודיעיני להגיע אליו, במערכת הביטחון ידעו להעריך את האזור שבו הוא נמצא. מאז הפיגוע, צוות משימה מיוחד בשב"כ פעל לאיתור המחבל, ובהמשך, על בסיס המודיעין המדויק, הצליחו להגיע לבית שבו הוא הסתתר.
בשב"כ הפעילו לחץ וביצעו פעולות גלויות כדי שאולי אחד מסייעניו ייחשף, וכשהגיעה ידיעת הזהב על מיקום הדירה ונקודת המסתור, הוחלט להכניס את הכוחות פנימה אל מחנה הפליטים במטרה לכתר את הבית ולתפוס את המחבל. במהלך הפעילות התפתחו חילופי אש, כוחות הביטחון גם ירו טילים אל עבר הבית שכיתרו קודם לכן, וחיסלו את כמה מחבלים, בהם מבצע הפיגוע בחווארה.