שעות לאחר פיגוע הירי שבוצע לעבר אוטובוס טירונים שנסע בבקעת הירדן - הזהות הארגונית של שני החשודים כמחבלים עדיין לא ידועה. כוחות הביטחון מבצעים סריקות אחר החשוד השלישי - שפרטיו פורסמו לציבור. בפיגוע נפצע קשה לוחם צה"ל ומצבו השתפר בהמשך לבינוני, ונפצעו חמישה חיילים נוספים ונהג האוטובוס שמצבם קל.
במערכת הביטחון עוקבים בדאגה אחר התגברות הטרור בתקופה האחרונה, כולל שימוש נרחב יחסית בנשק חם. בחודש האחרון התבצעו בגדה 11 פיגועי ירי ודקירה, כאשר מתחילת השנה סוכלו 200 פיגועי ירי. צפון הגדה – ובעיקר הערים ג'נין ושכם וסביבותיהן - בתקופה רותחת.
בעקבות הפיגוע בבקעה, במשטרת ישראל הוחלט להעלות את הכוננות בכל רחבי הארץ. כוחות משטרה רבים ייפרסו לפעילות ביטחון שוטף במקומות רגישים והומי קהל. כוחות צה"ל ומשטרה תפסו שני חשודים בביצוע הפיגוע בתוך רכבם, שעלה באש כתוצאה מהתלקחות של בקבוק תבערה שאותו התכוונו להשליך לעבר האוטובוס. ברשותם אותרו אמצעי לחימה, והם נתפסו וקשרו את עצמם לאירוע.
כוחות הביטחון ממשיכים בסריקות במרחב אחר חשוד נוסף: מאהר אל-סעיד, בן 50 תושב הכפר ג'יפטליק שבבקעה. שניים מפצועי הירי בפיגוע פונו במסוק לבית החולים רמב"ם שבחיפה. בבית החולים מסרו כי פצוע בינוני הועבר להשגחה במחלקה לטיפול נמרץ וכי פצוע קשה יועבר לחדר ניתוח לטיפול בפציעותיו ולאחר מכן יועבר לטיפול נמרץ.
נהג האוטובוס, בן 61, עבר ניתוח לטיפול בפציעות חודרות בפלג גופו העליון וצפוי לעבור עוד ניתוחים. מצבו מוגדר קשה, והוא יאושפז במחלקת טיפול נמרץ. מהמרכז הרפואי העמק נמסר כי שניים מארבעת החיילים שפונו לבית חולים בעקבות הפיגוע, שוחררו. חייל נוסף אושפז להמשך טיפול ואחד אחר עדיין מטופל במחלקה לרפואה דחופה.
בחמאס ובג'יהאד האיסלאמי בירכו על הפיגוע, ומגדודי אל-אקצא נמסר כי "המבצע הזה הוא חלק מהתגובה לפשעים של האויב בגדה המערבית, בעזה ובירושלים הכבושה". עוד הוסיפו בזרוע הצבאית של חמאס כי "אנחנו קוראים לכל הלוחמים בגדה להרחיב את התגובה בתקיפת מתנחלים בכל האמצעים העומדים לרשותם".
מתחקור ראשוני של האירוע עולה כי הטנדר שבו נסעו המחבלים נסע מאחורי האוטובוס, עקף אותו - ואז החמושים ביצעו את הירי. הנהג שנפגע מהירי עצר בצד הדרך, ויושבי הטנדר שפכו דלק וניסו לשרוף את האוטובוס. לפי הממצאים בזירה, המחבלים ירו יותר מ-20 קליעים לעבר האוטובוס, ומיקדו את הירי לעבר השמשה הקדמית.
לאחר הירי וניסיון הצתת האוטובוס, המחבלים הדליקו בקבוק תבערה שהתלקח בתוך הרכב לפני שהצליחו לזרוק אותו לעברו. כתוצאה מהתלקחות בקבוק התבערה, פרצה שריפה בתוך רכבם והם נאלצו לנטוש - כך אותרו ונעצרו. גשש מצא אותם בסמוך לטנדר השרוף, מסתתרים ומפוחדים. בתוך הטנדר נמצאו שני כלי נשק.
"פיגוע הירי היום בבקעת הירדן מצטרף לשורה של פיגועי ירי בימים האחרונים ביהודה ושומרון", אמר ראש מועצת בקעת הירדן, דוד אלחיני. "אני מאחל בריאות והחלמה לפצועים וסומך על צה"ל וכוחות הביטחון שיבואו חשבון עם המחבלים. תושבי הבקעה חזקים, ויש לי מסר ברור עבור כל מי שרוצה ברעתנו ומנסה לפגוע בנו - אנחנו נמשיך להתיישב, לפרוח, לשגשג ולגדול".
"אנחנו נמצאים בעיצומה של מתיחות גוברת בגבול הצפון ויו"ש", אמר יו"ר ועד הרבש"צים הארצי מבית ההסתדרות הלאומית איתי הופמן. "רבש"צים ביחד עם חברי מחלקות הגנת היישובים פועלים ברגעים אלו בהגנה על היישובים מפני מחבלים, תוך סיכון חייהם למען הגנת היישובים. לצערנו, משרד הביטחון, למרות הסיכון בו הרבש"צים חיים בו, לא מכיר ברכזי הביטחון הצבאיים הפועלים 24 שעות ביממה שבעה ימים בשבוע למען בטחון ארץ ישראל".