ניצב קובי יעקובי, נכנס לתפקידו כממלא מקום נציבת שב"ס והציג לפיקוד שב"ס את הנושאים שבכוונתו לקדם, על פי מדיניות השר לביטחון לאומי, איתמר בן גביר. יעקובי הציג את הדברים במסגרת ישיבת סגל הפיקוד הבכיר הראשונה שקיים.
ניצב יעקובי אמר כי שב"ס הוא חוליה חשובה ומרכזית בשרשרת הלחימה בטרור ובפשיעה ובכוונתו לפעול להחמרת תנאי הכליאה של האסירים הביטחוניים על פי דו"חות שנכתבו בנושא.
עוד הכריז על הקמת גוף מטה ייעודי לטיפול מקצועי באסירים הביטחוניים שיפעל ליישום מדיניות רוחבית בכלל האגפים ובתי הסוהר וכן יקדם את נושא החסימה הסלולרית. בנוסף, הכריז על קידום הקמת אגף ייעודי ובהמשך מתקן ייעודי לארכי מחבלים וראשי ארגוני פשיעה.
לדבריו לא ניתן להתעלם מפרשת הסוהרות ולכן פוליגרף הוא ערובה לטוהר מידות ולאמון הציבור במשרתיו.
הנציב הנחה כבר את יועמ"ש שב"ס לקדם במהירות תיקון לפקודת בתי הסוהר, כך שבדומה למשטרת ישראל, וכיאה לגוף בטחוני, יעברו קציניו הבכירים של הארגון ובעלי התפקידים הרגישים, בדיקות התאמה תעסוקתית הכוללות פוליגרף. בנוסף, תג"ד עירן נהון ישוב לשרת כיועמ"ש שב"ס.
לדבריו: "שב"ס עבר טלטלות לא פשוטות בתקופה האחרונה. בריחת האסירים הביטחוניים מבית הסוהר גלבוע, פתיחתה המחודשת של פרשת הסוהרות, אירועים נוספים וקשים שהתגלו בבית הסוהר רמון ובמתקנים נוספים – כל אלה מחייבים אותנו לבחינה מעמיקה וחסרת פשרות. אין בכוונתי לשרטט כאן תמונה שלילית ושחורה של הארגון, אבל אני לא מתכוון לעצום עיניים. זהו האתגר של כולנו. כאמור, אסור לנו לפטור את הפרשות האלה כבעיות מקומיות ורבים מהנושאים שעלו ואלו שעוד יעלו חלקם נגזרת מאירועי ולקחי העבר".