הלילה (בין ראשון לשני), שעות ספורות לפני יציאת המשלחת הישראלית לקטאר, צה"ל ושב"כ פתחו במבצע לילי ממוקד בבית החולים שיפא, בעקבות מידע מודיעיני על הימצאות בכירי חמאס במרחב. במהלך כיתור בית החולים פתחו המחבלים בירי לעבר כוחותינו מתוך מתחם בית החולים, הלוחמים השיבו אש, פגעו במחבלים והמשיכו לפעול במרחב.
הכוחות יצאו למבצע בעקבות מודיעין לפיו מחבלי חמאס ממשיכים להשתמש בתשתיות בית החולים כדי לנהל ולייצא פעולות טרור. "הכוחות הפועלים במרחב, הוכשרו למשימה ותודרכו מראש בעניין החשיבות במניעת פגיעה באזרחים, חולים, צוותים רפואיים וציוד רפואי", הדגיש דובר צה"ל תא"ל דניאל הגרי.
בהקלטה שנחשפה נשמע ראש מנהלת התיאום והקישור (רמת"ק) של עזה משוחח על הנושא עם מנכ"ל משרד הבריאות ברצועה. "אנחנו רואים שארגון הטרור חמאס ממשיך את הפעילות הצבאית שלו בתוך בתי החולים", אמר הרמת"ק. "אנחנו מוכנים לספק כל סיוע המוניטרי שיידרש. הבקשה שלנו היא פשוטה, הפסקה מיידית של כל פעילות הטרור בבתי החולים, כמו שראינו בבית החולים בח'אן יונס".
ד"ר יוסף אבו ריש השיב: "קיבלנו את ההודעה שלך ואני מבטיח לך שאנחנו באותו עמדה. בתי החולים צריכים להיות מקום למתן שירותים ואסור שאף אחד יפגע במטופלים או במתן הטיפול הרפואי בתוך בתי החולים האלה".
עוד מסר דובר צה"ל כי "גם במהלך המבצע, צה"ל מבטיח את המשך פעילות בית החולים, והביא דוברי ערבית לשטח, כך שיוכלו לקיים שיח עם החולים השוהים בבית החולים. רופאי צה"ל ערוכים לסייע לנזקקים לכך. החולים והצוותים הרפואיים אינם חייבים להתפנות מבית החולים, אך יש מעבר ליציאת אזרחים מהמרחב".
בצה"ל מבהירים כי בהמשך המבצע ולאחר שלא תשקף סכנה לחיי הלוחמים, צה"ל ימשיך את המאמץ ההומניטרי ויספק מזון, מים ואספקה נוספת לחולים ולאזרחים במתחם. מדובר צה"ל נמסר: "צה"ל ימשיך לפעול בהתאם לדין הבינלאומי וכנגד ארגון הטרור חמאס, הפועל מתוך בתי חולים ותשתיות אזרחיות בדפוס פעולה שיטתי וציני, ללא הבחנה בין האוכלוסייה האזרחית לבין מחבלי הארגון".