קרוהן היא מחלת מעי דלקתית שעשויה לפגוע בכל חלק של מערכת העיכול - מהפה ועד פי הטבעת, אם כי השכיחות הגבוהה ביותר היא באזורי המעי הדק והמעי הגס. ההשערה המקובלת לגבי מנגנון המחלה היא שבאנשים חשופים גנטית, מערכת החיסון שבאזור המעי פועלת ביתר, שלא לצורך, בתגובה למרכיב בחלל המעי - קרוב לוודאי מרכיב של מיקרואורגניזם בחלל המעי. כתוצאה, מתפתחת דלקת ואיתה גם תסמיני המחלה.