כשהחל את הקריירה בבית"ר ירושלים שיחק עמית בן שושן בתפקיד החלוץ. גם בנבחרת שיחק בחוליית ההתקפה ואף כבש שער חשוב מול רוסיה ב-2006. עם השנים בבירה הוסב תפקידו לעמדת הכנף, ובעונה האחרונה במכבי נתניה שיחק לעיתים בקישור. בעונה הבאה עשוי בן שושן להחליף שוב עמדה הפעם להגנה. שחקנה של מכבי נתניה מבוקש בארמיס ובאומוניה ניקוסיה מהליגה הקפריסאית אשר מייעדות לו את תפקיד המגן הימני.
"זה תפקיד שמאוד מוכר לי כי שיחקתי בו שנתיים במחלקת הנוער של בית"ר וגם בקפריסין ככה שאני לא מופתע", אמר בן שושן, שהתנסה בתפקיד מספר פעמים כאשר שיחק באנורטוזיס. השחקן כאמור חווה עונה לא פשוטה במדי מכבי נתניה. הוא היה שחקן הרכב קבוע עד המחזור השביעי, בו שבר את אחת האצבעות בכף רגלו מה שגרם לו להיעדר חודשיים וחצי באמצע העונה.
בן שושן גדל במחלקת הנוער של ביתר ירושלים, איתה זכה בשתי אליפויות ושני גביעים בעידן גאידמק. הוא גם שימש כקפטן הקבוצה במשך שנתיים בגיל 25 עד שעזב את המועדון לטובת אנורתוזיס הקפריסאית.
